Les villes ont un certain nombre d'organismes microbiens distinctifs qui font que chaque métropole a ses propres empreintes digitales, une sorte d'ADN qui aide à identifier où vous vivez.
Chaque ville a sa propre empreinte digitale. C'est ce qu'ont découvert dans une nouvelle étude des chercheurs qui ont prélevé des milliers d'échantillons dans les transports publics de 60 métropoles du monde entier. Chaque lieu est peuplé d'un ensemble unique d'organismes microbiens qui confèrent à la zone une sorte d'ADN distinctif grâce auquel il est fort probable que vous puissiez identifier l'endroit où vous vivez par l'empreinte de votre chaussure.
Les empreintes digitales des villes
Pour identifier les "empreintes digitales" de chaque ville, divers points de contact tels que les tourniquets et les rampes des métros ou des stations de bus bondés ont été écouvillonnés. Plus de 4 700 échantillons recueillis ont été soumis à un séquençage métagénomique, l'étude du matériel génétique collecté dans l'environnement, et les scientifiques ont créé un atlas mondial de l'écosystème microbien urbain, qui pourrait devenir le premier catalogue systématique de ce type.
Les résultats montreraient qu'aucune ville ne se ressemble, chaque grande métropole analysée révélant une écologie moléculaire unique des espèces microbiennes qui l'habitent, distincte des populations présentes dans d'autres environnements urbains. En outre, au cours des 3 années d'étude, des milliers de micro-organismes non identifiés auparavant ont été identifiés, dont près de 11 000 virus et plus de 1 300 types de bactéries qui ne correspondaient à aucune espèce connue.
Le projet a commencé par l'analyse d'échantillons microbiologiques provenant de la région métropolitaine de New York et s'est depuis étendu à 32 pays sur 6 continents, impliquant des dizaines de scientifiques de plus de 60 organisations de recherche. La biologiste systémique Christipher Mason, de l'université Cornell, a ainsi fondé MetaSUB, une collaboration internationale qui tente de documenter le biome urbain avec lequel des millions de personnes interagissent chaque jour.
"Il est clair que les villes, en général, ont un impact sur la santé humaine, bien que les mécanismes de cet impact soient très variables et souvent mal compris", écrivent les chercheurs dans leur nouvelle étude. "Notre compréhension de la dynamique microbiologique, expliquent-ils, dans un contexte urbain, en dehors des pandémies, ne fait que commencer."
Les écouvillons de la recherche ont en effet tous été collectés avant le début de l'urgence sanitaire provoquée par le Covid-19 et ont montré que sur 4 728 échantillons métagénomiques, dans la majorité des cas, on était confronté à des microbes inconnus. Au total, 10 928 virus, 1 302 bactéries, 2 archées et 838 532 matrices CRISPR, ou fragments d'ADN viral, ont été identifiés sans correspondance dans les bases de données de référence.
Les scientifiques ont indiqué qu'une gamme de 31 espèces de microbes non humains a été trouvée dans 97% des échantillons. Avec cette étude, les chercheurs espèrent découvrir de nouveaux moyens d'identifier les menaces pour la santé dans les populations microbiennes, comme les souches de bactéries résistantes aux antibiotiques.
En ce qui concerne Covid-19, cependant, la protéine Spike a été transformée en musique par le MIT, Markus Buehler ayant créé la symphonie 'Antibody Protein in E Minor'.